Vielleicht hast du nur nen Schlauch abgeklemmt oder bei der Entdrosselung was falsch gemacht?
Der Unterschied bei den Filtern ist nicht derartig groß, dass das deine Probleme erklären würde.
Bau mal den anderen wieder ein, und kontrollier das Fahrverhalten.
Dann wieder umbauen und die Chance, den Fehler nebenbei behoben zu haben ist groß
