Eine allgemeine Liste gibt's hier:
http://www.gs-500.de/viewtopic.php?t=5426
GS-spezifisch: Motorlauf anhören. Wenn vom Kurbeltrieb ein hartes Klopfen kommt, hat sie einen Lagerschaden. Häufiger (und teurer) Schaden bei schlechter Wartung (fast ohne Öl gefahren.)
Rost am Krümmer haben sie alle. Am Rahmen leider auch fast alle. Sturzschäden würde ich persönlich nicht überbewerten. Die GS ist ein Anfängerfahrzeug. Die liegen irgendwann alle mal. Darf einfach nichts krumm sein (Probefahrt.) Preisnachlass dafür liegt aber natürlich immer drin.
Viele andere Geräusche sind normal, siehe:
http://www.gs-500.de/viewtopic.php?t=5999